Kafes vertelt het verhaal van zij die de spanningen in de aanloop naar 1980 en de daarop volgende jaren meemaakten. Alles begint met Mehmet Sipahi en zijn kameraden Ihsan en Celal, die de moord op Dursun Önkuzu willen wreken.
Murat wordt gemanipuleerd in een hopeloze situatie door groepen die er belang bij hebben chaos te creëren. Terwijl iedereen door de oplaaiende strijd in angst leeft, worden Elif en Mehmet Sipahi verliefd. Hoewel ze totaal verschillende opinies hebben op politiek vlak, kiezen toch voor elkaar.
Mehmet Sipahi, een man die uit overtuiging alles zou doen voor z’n land en z’n volk, komt in conflict met de mensen die het dichtst bij hem staan. Mustafa en Kadir zijn twee jeugdvrienden, afkomstig uit dezelfde wijk. Één van hen is links en de andere verafgoodt Mehmet als een idool. Kadir, die zichzelf als revolutionair beschouwt, laat zich overtuigen door Mahmut om Mehmet Sipahi te vermoorden. Mustafa wordt zonder het zelf te beseffen deel van het vuile spel dat Murat speelt.